San Franciscossa matkailijoiden on mahdollista majoittua näyttävien merimaisemien äärellä. Kaupunki sijaitsee aivan San Franciscon niemimaan kärjessä, San Franciscon lahden ja Tyynenmeren ympäröimänä. Monet kaupungin hulppeimmista hotelleista sijaitsevatkin lähellä rantaa. Jos matkabudjetti ei ole ongelma, varaa täyden palvelun hotelli merimaiseman kera kaupungin satama-alueiden lähettyviltä. Esimerkiksi Embarcaderon alueen tuntumasta. Laatuhotellien hinnat ovat meren äärellä normaalisti noin 250 dollarista (noin 203 euroa) ylöspäin. Budjettimatkaaja joutuu usein valitsemaan yksinkertaisemman 2 tähden hotellin. Halpa hotelli voi toki olla hyvä valinta, kunhan majapaikka on siisti ja turvallinen.
Suuren edullisten ja keskihintaisten hotellien keskittymän matkailija voi löytää Lombard Street -kadun lähistöltä. Alue sopii hyvin niille, jotka haluavat majoittua rannan tuntumassa kohtuuhintaan. Vaikka merinäköala puuttuukin, on satama-alueille kadulta kävelymatka. Lombard Streetin 2–3 tähden majapaikat ovat enimmäkseen pieniä hotelleja tai bed & breakfast -tyyppisiä majataloja. Kaupunginosa on rauhallinen ja sopiva valinta lapsiperheille. Lombard Street on itsessään nähtävyys, sillä sen Russian Hill -kaupunginosan puoleinen pää on tunnettu monista mutkistaan ja kukkaistutuksistaan.
Monet hotellit San Franciscossa sijaitsevat kaupungin kiireisessä keskustassa. Varsinkin kiinalaiskaupunginosan Chinatownin kulmilla majoituspaikkoja on valtava valikoima. Hintahaitari on suuri, sillä hotelliyöstä kaupunginosassa voidaan pyytää alueella mitä tahansa 70 ja yli 400 dollarin (noin 57–325 euroa) välillä, riippuen hotellin tasosta. Luksusta alueella tarjoaa esimerkiksi neljän tähden Fairmont San Francisco, jossa ruhtinaallinen hotellikokemus aamiaisineen ja kylpyammeineen on taattu. Parhaissa hotelleissa on yleensä myös uima-allas. Reppureissaajien on puolestaan mahdollista löytää Chinatownin lähistöltä trendikäs hostelli alkaen 50–60 dollarin (noin 40–50 euroa) vuorokausihintaan. Ravintoloiden ja baarien täyttämä alue sopii hyvin nuorille ja muille San Franciscon yöelämässä viihtyville.
