Monet suosituimmat hotellit Lyypekissä sijaitsevat vanhassa kaupungissa, joka tunnetaan nimellä Altstadt. Vanha kaupunki sijaitsee omalla saarellaan kaupungin keskustassa, ja alueella voi ihailla kanaali- ja jokimaisemia muun muassa Trave-joen yli. Lyypekin historiallinen kaupunginosa sopii kaikille vanhasta arkkitehtuurista pitäville ja tunnelmallista majapaikkaa etsiville. Alueella on pieniä hotellia esimerkiksi romanttista lomaa viettävien pariskuntien makuun. Kaupunginosa viehättää vierailukohteidensa ansiosta myös kulttuurin ystäviä. Vanhassa kaupungissa sijaitsee muun muassa Museumsquartier St. Annen -museo. Kaunis ja laadukas hotellivalinta historiallisissa kortteleissa on esimerkiksi Klassik Altstadt Hotel Lübeck.
Säästöbudjetilla matkaileville ja reppureissaajille on hyvä valikoima hotelleja lähellä rautatieasemaa. Alue sopii kaikille niille, jotka haluavat yöpyä hyvien kulkuyhteyksien äärellä, sillä Lübeck Hbf -asemalta on vilkkaat junayhteydet Saksan eri osiin. Alueelta on lyhyt kävelymatka vanhaan kaupunkiin. Hyvä budjettiluokan hotellivaihtoehto alueella on Hotel Lindenhof Lübeck. Edullisen majoituksen saat myös B&B Hotel Lübeck -majatalosta.
Majoitus Lyypekissä onnistuu myös kaupungin ulkopuolella. Oberbüssaun alueella sijaitseva Ringhotel Friederikenhof on idyllinen maalaishotelli vehreiden maisemien keskellä. Alue sopii matkailijoille, jotka haluavat yhdistää Lyypekin kaupunkilomaan rentoutushetken maaseudun rauhassa. Alueelta on noin 20 minuutin ajomatka Lyypekin lentokentälle ja noin 25 minuutin ajomatka kaupungin keskustaan.