Hotellit Pisassa sijaitsevat suurimmalta osin lähellä keskustaa. Pisan kaupunki on kompaktin kokoinen, joten keskustamajoitus on suositeltavaa. Näin kaikki palvelut ja nähtävyydet ovat lähellä. Paras alue majoittua Pisassa on lähellä rautatieasemaa, Piazza dei Miracolia, tai Arno-joen rannan äärellä. Kaupungin ulkopuolella rantakohteessa yöpyminen on hyvä vaihtoehto, jos kaupunkiloman haluaa yhdistää rantaelämään. Pisan lentokenttä, Galileo Galilei, sijaitsee muutaman kilometrin päässä keskustasta. Lentokentän lähellä ei ole varsinaista erillistä lentokenttähotellia, vaan sitä lähimmät hotellit sijaitsevat kaupungin keskustassa.
Keskustan alue soveltuu hyvin lapsiperheille tai lyhyellä vierailulla oleville matkustajille, joille on tärkeää, että kaikki palvelut ja nähtävyydet ovat käden ulottuvilla. Esimerkiksi Hotelli Bologna Pisa on pienehkö keskitason hotelli, joka sijaitsee erinomaisella paikalla Pisan keskustassa, lähellä Pisan kuuluisaa kaltevaa tornia ja Piazza dei Miracolia. Hotellilla on hyvä sijainti ja mainio hinta-laatusuhde. Kahden hengen standard-huoneen hinta alkaa noin 95 eurosta ja voi vaihdella hieman sesongin mukaan.
Lähellä rautatieasemaa, Duomo de Pisan katedraalia ja Battistero de San Giovannin kappelia sijaitsee hyvätasoinen NH Pisa-hotelli, jossa on hyvin varustellut nykyaikaiset huoneet. Kahden hengen standard-huoneen hinta alkaa noin 113 eurosta. Pisan rautatieaseman alue sopii etenkin matkailijoille, jotka suunnittelevat käyttävänsä Pisaa tukikohtana Toscanan alueella matkustamiseen. Juna-asemalta on mainiot yhteydet eri puolille Italiaa.
Pisan hurmaavassa vanhassa kaupungissa on vähemmän hotelleja alueen kapeista kaduista ja rakennusten pienestä koosta johtuen. Suosittu hotellivaihtoehto vanhan kaupungin laidalla on klassinen Royal Victoria Hotel, joka on toimiva keskitason hotelli lähellä tunnelmallista Arno-joen rantaa. Romanttinen vanhan kaupungin alue ja Pisan kaupungin maalauksellinen joenranta sopivat erinomaisesti pariskunnille. Alueella on myös lukuisia kahviloita ja ravintoloita, joissa pääset tutustumaan italialaisen keittiön suussa sulaviin herkkuihin.
